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Intergenic view options: Interleaved

NC_000964.1 Bacillus subtilis (+ 1629370 to 1629780) circular

Term (99.80)%  -----------------------------------------------------CAGGCTGTGAGGCCTG-----------
Islands  ,,,,.,,,..C,,,.GA.G.,,,GAGGC..C,,,GCC..GC.G.AC..G,,,,CAGGC.G.GAGGCC.G.......A..A
5'-   AAAATAAATTCAAATGATGTAAAGAGGCTTCAAAGCCTTGCTGTACTTGAAAACAGGCTGTGAGGCCTGTTTTTTTATTA
  |         |         |         |         |         |         |         |         
  1629370   1629380   1629390   1629400   1629410   1629420   1629430   1629440   
  |         |         |         |         |         |         |         |         
3'-   TTTTATTTAAGTTTACTACATTTCTCCGAAGTTTCGGAACGACATGAACTTTTGTCCGACACTCCGGACAAAAAAATAAT
Islands  ....A...AAG...AC.ACA...C.CCGAAG...CGGAACGACA.GAAC....G.CCGACAC.CCGGAC,,,,,,,.AA.
Term (68.32)%  -----------------------------------------------------GTCCGACACTCCGGAC-----------

  
Islands  A.CC.A.,,,,,,,G.CGGG..GAC..A.G..AGAA..G.GC.,,,,...AC.AC,,,.C.,,,,,C..A.CAAGAGCGG
5'-   ATCCTATAAAAAAAGTCGGGTTGACTTATGTTAGAATTGTGCTAAAATTTACTACAAATCTAAAAACTTATCAAGAGCGG
  |         |         |         |         |         |         |         |         
  1629450   1629460   1629470   1629480   1629490   1629500   1629510   1629520   
  |         |         |         |         |         |         |         |         
3'-   TAGGATATTTTTTTCAGCCCAACTGAATACAATCTTAACACGATTTTAAATGATGTTTAGATTTTTGAATAGTTCTCGCC
Islands  .AGGA.A.......CAGCCCAAC.GAA.ACAA.C..AACACGA....,,,.GA.G...AGA.....GAA.AG..C.CGCC

  
Islands  C.GAGGGAC.GGACC.A.GAAGCCCGGCAACC.GCA.AG...G.AAGG.GC.AC..CCAGC,,,,.GAA..CCA....G,
5'-   CTGAGGGACTGGACCTATGAAGCCCGGCAACCTGCATAGTTTGTAAGGTGCTACTTCCAGCAAAATGAATTCCATTTTGA
  |         |         |         |         |         |         |         |         
  1629530   1629540   1629550   1629560   1629570   1629580   1629590   1629600   
  |         |         |         |         |         |         |         |         
3'-   GACTCCCTGACCTGGATACTTCGGGCCGTTGGACGTATCAAACATTCCACGATGAAGGTCGTTTTACTTAAGGTAAAACT
Islands  GAC.CCC.GACC.GGA.AC..CGGGCCG..GGACG.A.C,,,CA..CCACGA.GAAGG.CG....AC..AAGG.,,,,C.

  
Islands  ,,GA.AAGGGC.GCA.GC.G..CC.G.C...C...CCGCCGGA..G,,,G......A....AAGAGG.,,,,,GGC.A.C
5'-   AAGATAAGGGCTGCATGCTGTTCCTGTCTTTCTTTCCGCCGGATTGAAAGTTTTTTATTTTAAGAGGTAAAAAGGCTATC
  |         |         |         |         |         |         |         |         
  1629610   1629620   1629630   1629640   1629650   1629660   1629670   1629680   
  |         |         |         |         |         |         |         |         
3'-   TTCTATTCCCGACGTACGACAAGGACAGAAAGAAAGGCGGCCTAACTTTCAAAAAATAAAATTCTCCATTTTTCCGATAG
Islands  ..C.A..CCCGACG.ACGACAAGGACAG,,,G,,,GGCGGCC.AAC...C,,,,,,.,,,,..C.CCA.....CCGA.AG

  
Islands  .G.A.A.CAGCAGCCGCGAA.CACA..ACA.GGG,,,,GACAACCGGCAG,,,GC.AC.G...G...G.C.CCG,,,GGA
5'-   TGTATATCAGCAGCCGCGAATCACATTACATGGGAAAAGACAACCGGCAGAAAGCTACTGTTTGTTTGTCTCCGAAAGGA
  |         |         |         |         |         |         |         |         
  1629690   1629700   1629710   1629720   1629730   1629740   1629750   1629760   
  |         |         |         |         |         |         |         |         
3'-   ACATATAGTCGTCGGCGCTTAGTGTAATGTACCCTTTTCTGTTGGCCGTCTTTCGATGACAAACAAACAGAGGCTTTCCT
Islands  ACA.A.AG.CG.CGGCGC..AG.G.AA.G.ACCC....C.G..GGCCG.C...CGA.GAC,,,C,,,CAGAGGC...CC.

  
Islands  GG,,,GAAGAA
5'-   GGAAAGAAGAA
  |         |
  1629770   1629780   
  |         |
3'-   CCTTTCTTCTT
Islands  CC...C..C..

IGR  +  1629370  1629780  ()  41  cysH ylnA

Blast Hits

ID Organism Class Accession Start End Operon
0 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 + 1629370 1629780 cysH ylnA [COG0175 COG0306]
1 Listeria innocua Clip11262 B/C NC_003212.1 - 1772247 1772656 metK [COG0192]
2 Oceanobacillus iheyensis B/C NC_004193.1 + 3200452 3200962 OB3079 [COG0431]
3 Thermoanaerobacter tengcongensis strain MB4T B/C NC_003869.1 - 1750207 1750551 MetF MetH2 EbsC [COG0685 COG0646|COG1410 COG2606]
4 Clostridium tetani E88 B/C NC_004557.1 + 303232 303525 CTC00321 [COG0192]
5 Oceanobacillus iheyensis B/C NC_004193.1 + 1318940 1319214 OB1276 [-]
6 Oceanobacillus iheyensis B/C NC_004193.1 - 1097834 1098421 OB1054 [COG0620]
7 Oceanobacillus iheyensis B/C NC_004193.1 - 3466292 3466717 OB3328 OB3327 [COG0371 COG1464]
8 Oceanobacillus iheyensis B/C NC_004193.1 + 726566 727206 OB0691 [COG0646]
9 Oceanobacillus iheyensis B/C NC_004193.1 + 3161995 3162284 OB3048 [COG2873]
10 Oceanobacillus iheyensis B/C NC_004193.1 - 2437082 2437389 OB2384 OB2383 [COG1135 COG2011]
11 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 B/C NC_004461.1 + 588039 588290 SE0600 SE0601 SE0602 [COG1135 COG2011 COG1464]
12 Thermoanaerobacter tengcongensis strain MB4T B/C NC_003869.1 + 500148 500404 MetK [COG0192]
13 Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 B/C NC_004461.1 - 1940269 1940573 SE1902 [COG1757]
14 Clostridium perfringens B/C NC_003366.1 - 2664969 2665304 CPE2317 [COG1757]
15 Clostridium tetani E88 B/C NC_004557.1 - 2676797 2677154 CTC02520 [COG1757]
16 Thermoanaerobacter tengcongensis strain MB4T B/C NC_003869.1 - 2076498 2076819 ThrA MET17 [COG0460 COG2873]
17 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 - 1180070 1180382 yitJ [COG0646|COG0685]
18 Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 B/C NC_002745.1 + 875326 875574 SA0769 SA0770 SA0771 [COG1135 COG2011 COG1464]
19 Listeria monocytogenes strain EGD B/C NC_003210.1 - 1739385 1739673 lmo1681 lmo1680 lmo1679 lmo1678 [COG0620 COG0626 COG0626 COG0646|COG0685]
20 Listeria monocytogenes strain EGD B/C NC_003210.1 - 2490968 2491284 lmo2419 lmo2418 [COG1135 COG2011]
21 Listeria monocytogenes strain EGD B/C NC_003210.1 - 309156 309537 lmo0285 lmo0284 lmo0283 [COG1464 COG1135 COG2011]
22 Listeria innocua Clip11262 B/C NC_003212.1 - 327107 327488 lin0313 lin0312 lin0311 [COG1464 COG1135 COG2011]
23 Chlamydia trachomatis P/C/V NC_000117.1 - 685306 685502 ybbC [COG3876]
24 Clostridium tetani E88 B/C NC_004557.1 - 1226135 1226391 CTC01153 CTC01152 [COG2873 COG1897]
25 Clostridium tetani E88 B/C NC_004557.1 - 1456595 1456836 CTC01355 [COG1135]
26 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 - 3128109 3128610 metK [COG0192]
27 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 - 2024332 2024654 yoaD yoaC [COG0111 COG1070]
28 Clostridium acetobutylicum ATCC824 B/C NC_003030.1 - 2914619 2914948 cysD [COG2873]
29 Clostridium acetobutylicum ATCC824 B/C NC_003030.1 + 1976292 1976570 metB [COG1897]
30 Clostridium acetobutylicum ATCC824 B/C NC_003030.1 - 671177 671507 metH [COG0646|COG1410]
31 Bacillus halodurans B/C NC_002570.1 - 3590493 3590933 BH3481 BH3480 [COG1135 COG2011]
32 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 + 3996502 3996755 yxjH [COG0620]
33 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 + 3997779 3998140 yxjG [COG0620]
34 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 - 3363351 3363676 yusC yusB yusA [COG1135 COG2011 COG1464]
35 Listeria monocytogenes strain EGD B/C NC_003210.1 - 1716436 1716857 metK [COG0192]
36 Clostridium acetobutylicum ATCC824 B/C NC_003030.1 + 1131346 1131719 CAC0984 CAC0985 CAC0986 [COG1135 COG2011 COG1464]
37 Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 B/C NC_002745.1 - 2381517 2381674 SA2117 [COG1757]
38 Bacillus subtilis B/C NC_000964.1 + 1426304 1426499 ykrW ykrX ykrY ykrZ [COG1850 COG4359 COG0235 COG1791]
39 Bacillus halodurans B/C NC_002570.1 - 909950 910271 BH0835 [-]
40 Bacillus halodurans B/C NC_002570.1 + 1348738 1349025 BH1253 [COG0460]

0  ________________________________________________________________________________
1  AGATACAATCTCCTTTAGATAAGTAAAACATCTTTTTTATCCATCTATCATACCACAGGATGGAAAT-------------
2  TTTCATCCCCCATTATCTATCGTTAGTAATTAAAAAACCCTTTTCATAAAGATAAGAAAAGAGCTCTGTCGCCGACTTCT
3  ATTAATCCTCCTTATTTGCAACAGTAGTTAACTATATT------------------------------------------
4  --------------------------------------------------------------------------------
5  --------------------------------------------------------------------------------
6  GAAATACCTCTTTCTAAAACAATTCAATGTATAAATGAGCTTATTGTTATTTTATCGTTCCAAGATGGAATTGCAAGACA
7  TTTCAATTAGGTAATAAAAAAAGGAGTTAATTTACCTCCTTTTTTTCTTTAATA--------------------------
8  TTTCATCGCTCCTCCTACTATGATTGATAATAGTATAACAAACGAATCGTATAATTAATAAACTATCTTTATAAAAATGT
9  --------------------------------------------------------------------------------
10  --------------------------------------------------------------------------------
11  --------------------------------------------------------------------------------
12  --------------------------------------------------------------------------------
13  --------------------------------------------------------------------------------
14  --------------------------------------------------------------------------------
15  AGCAACACCTCAAATATAAAAAATTTATTAGTTAATGATAAGTATATAG-------------------------------
16  --------------------------------------------------------------------------------
17  --------------------------------------------------------------------------------
18  --------------------------------------------------------------------------------
19  --------------------------------------------------------------------------------
20  --------------------------------------------------------------------------------
21  --------------------------------------------------------------------------------
22  --------------------------------------------------------------------------------
23  --------------------------------------------------------------------------------
24  TTGTTAAATTTTTGGGGAGAATTTTTGGGGACGGTTAATGAAA-------------------------------------
25  --------------------------------------------------------------------------------
26  ATGAAACCTTCCTTTATCGTTTTTTGTGTTTTGCTAATTGTGAATTAGTATA----------------------------
27  --------------------------------------------------------------------------------
28  --------------------------------------------------------------------------------
29  --------------------------------------------------------------------------------
30  --------------------------------------------------------------------------------
31  --------------------------------------------------------------------------------
32  --------------------------------------------------------------------------------
33  GCCCGCAGTGCGGTTTCGCCTCTACAGAAGAAGGCAACCTT---------------------------------------
34  --------------------------------------------------------------------------------
35  AGATACAATCTCCTTTAGTTAAGTAAAACATCTTTTTTATCCATCTATCATACCACAGGTTGGAAATAATGATAAGTGA-
36  AGATTAGAATTTGATTATTTAGTGTT------------------------------------------------------
37  --------------------------------------------------------------------------------
38  --------------------------------------------------------------------------------
39  --------------------------------------------------------------------------------
40  --------------------------------------------------------------------------------

  
0  ________________________________________________________________________________
1  --------------------------------------------------------------------------------
2  CTTATCTACCAAGCATAGAATACTTGATGGATTTGGCACAGTATTCAAGCTAGAACCTGTTGCCGAGGCTTCTTTGGGCC
3  --------------------------------------------------------------------------------
4  --------------------------------------------------------------------------------
5  --------------------------------------------------------------------------------
6  AAGGAACTAAAATAAGTTCCAAAAACAAATTAATATAGGTAGAGAATCCGTGCTAATATTAACTCCAAAATGCATGACTT
7  --------------------------------------------------------------------------------
8  TGCGCTGCTTGATTTTTTCGTTCAGTCGAATCGCTTTTTTGCTGCCATTCACCGATCCAACTAACTAGTAAAAGAAAAGT
9  --------------------------------------------------------------------------------
10  --------------------------------------------------------------------------------
11  --------------------------------------------------------------------------------
12  --------------------------------------------------------------------------------
13  --------------------------------------------------------------------------------
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39  --------------------------------------------------------------------------------
40  --------------------------------------------------------------------------------

  
0  ________________________________________________________________________________
1  --------------------------------------------------------------------------------
2  ATTTCCCTC-----------------------------------------------------------------------
3  --------------------------------------------------------------------------------
4  --------------------------------------------------------------------------------
5  --------------------------------------------------------------------------------
6  AAATGCCCTCAACA------------------------------------------------------------------
7  --------------------------------------------------------------------------------
8  CCTTTTCTAGAAGCGCTCTAATGCCCAAAAATCTAGAAAAATACTAGGGAATTGGTGAATAGAAGCGCTCTAATAACCAA
9  --------------------------------------------------------------------------------
10  --------------------------------------------------------------------------------
11  --------------------------------------------------------------------------------
12  --------------------------------------------------------------------------------
13  --------------------------------------------------------------------------------
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36  --------------------------------------------------------------------------------
37  --------------------------------------------------------------------------------
38  --------------------------------------------------------------------------------
39  --------------------------------------------------------------------------------
40  --------------------------------------------------------------------------------

  
0  _____________________________________________________________________________AAA
1  -----------------------------------------------------------------------------AAT
2  -----------------------------------------------------------------------------CAC
3  -----------------------------------------------------------------------------ATA
4  --------------------------------------------------------------------------------
5  --------------------------------------------------------------------------------
6  -----------------------------------------------------------------------------GAG
7  -----------------------------------------------------------------------------TAT
8  GTATCTTATAAAAAGTGTGTGCTGGTTCTTTGCAATAATAGCTCTTGGTTTTCTTTCAATTTGCTATATTTTACGATTGG
9  --------------------------------------------------------------------------------
10  --------------------------------------------------------------------------------
11  --------------------------------------------------------------------------------
12  --------------------------------------------------------------------------------
13  --------------------------------------------------------------------------------
14  --------------------------------------------------------------------------------
15  -----------------------------------------------------------------------------TAA
16  --------------------------------------------------------------------------------
17  --------------------------------------------------------------------------------
18  --------------------------------------------------------------------------------
19  --------------------------------------------------------------------------------
20  --------------------------------------------------------------------------------
21  ------------------------------------------------------------------------------TT
22  -------------------------------------------------------------------------------T
23  --------------------------------------------------------------------------------
24  -----------------------------------------------------------------------------ATT
25  --------------------------------------------------------------------------------
26  -----------------------------------------------------------------------------ACA
27  -------------------------------------------------------------------------------G
28  --------------------------------------------------------------------------------
29  --------------------------------------------------------------------------------
30  -----------------------------------------------------------------------------TTT
31  --------------------------------------------------------------------------------
32  --------------------------------------------------------------------------------
33  -----------------------------------------------------------------------------CTG
34  --------------------------------------------------------------------------------
35  -----------------------------------------------------------------------------AAA
36  -----------------------------------------------------------------------------AGC
37  --------------------------------------------------------------------------------
38  --------------------------------------------------------------------------------
39  --------------------------------------------------------------------------------
40  --------------------------------------------------------------------------------

  
0  ATAAATTCAAATGATGTAAAG_AGGCTTC__AAAGCCTTG_CTG__TACTTGAAAACAGGCTGTGAGGCCTGTT_TTTTT
1  GATAAGTGAAAAATAAAGGAA-GGCACTT--TTTTACTGT-TTT--TTGCAAATGGAAATCAAGACAAAACCGA-ATTTT
2  CTCTCAGGATAAGATATTTCA-TTATTTA--GTTTGTTGC-CAC--GATAATAATACAAGTTGATAGAATTGTC-AATTA
3  ATATTAAACCTCTGGTTATGC-AAGTGTT--TGCACAAAA-AAG--AAATGGAGGAGCGGATGAAATTGAAAAT-TTTCT
4  --------------------------------------------------AAAAATAACACTAATATTAGTGTTATTTTT
5  -------------------------------------------A--AAATTGAATGTAGACAAATTATTATACA-AGTTG
6  CCGAATACTTTACATGTTTTG-AAATCTT--TATGATCTT-TCG--TTCAGCGTAGTACTGCCCGGCTAGAAGC-ACAAA
7  TCCCTTTTTAGATATATACAT-ATATATG--TAATTGGAT-GCT--TATTCTGTCTTAAATGAGTTTTCAACTA-GTATC
8  TTATGTTGAGCTTGATTTACA-ACCTTTC--ACTACGAAC-AAA--AATCAGCTTTTCTAAATTATAATAAATT-TCACT
9  ------------------------------------------------------------------ATTTTTAA-ATAAT
10  ----------------------------------------------------------------------AAAA-ATTAA
11  --------------------------------------------------------------------------------
12  ------------------------------------------------------AGTGCGCTTTTTAGCGCGCT-TTTTT
13  -------------------------------------------------------------------------A-CTATT
14  -----------------------------------------------------------------------------ATT
15  TAATATATGTATATCAACTTT-TTAAAGG--TTATTCATT-GTT--TATTTTTACCTATCCACTAAATAAAAAT-TTTGT
16  ----AAAAATTCCCCCTCAAT-CTTTTGC--TTTATTATA-ACA--GAAATTAGTAATAAAAGCAAGGGAAAAT-TTTTT
17  --------------------------------------AT-TTT--CTGATTCCTATTGATTATTGTCTTTATT-TTCGG
18  --------------------------------------------------------------------------------
19  ----------------------------------------------------------------------TGAT-TGACA
20  ---------------------------------ATTAATA-TAA--GTGAGAAAGTTATTGACAAAGTCTACTA-GAAAA
21  GGCACCCGTCCTTTTCAAGTT-TCATTGA--TTAAAATAG-TAA--AGTTTTCTGAAGTATTTGTCCAGTATGA-TTTTT
22  TGGCACCCGTCCTTTTCAAGT-TTCATTG--ATTAAAATA-GTA--AAGTTTTCTGAAGTATTTGTCCAGTATG-ATTTT
23  --------------------------------------------------------------------------------
24  TGCCATAACAATGGTAAACTT-TCATTAA--CCGTCCCTT-CTA--TTTTCTTCTATTTTGAAAAATAACTATC-CAATA
25  --------------------------------------------------------------------------------
26  TATATTTTCAAATAGTCTATA-CTATTTA--TTGTTTTTT-GTG--TGTGCATTTCCATTGTTTTCCCTCAATA-TAGGT
27  GCCCAGTTCCTCTCTCTAGTT-AGATATT--TTGTAAGAA-TTA--TAACATTTCCGATGATAACGTCAATTCT-GAAAA
28  --------------------------------------TT-GAA--AATCTATTGACAGATTTATATAAAATGA-TATAA
29  -----------------------------------------------------------------GCAGATTTT-CTAAG
30  ATAACATCCAATT-TATAAAGTAATTTTCCTAAAGTCTTAACTGGATAAATGAAATATCTATAATAAATATATG-TATTT
31  --------------------------------------AC-GAA--AATTTAAACTATTTTACTATTGTTGACA-AGGAC
32  --------------------------------------------------------------------------------
33  ACAGAGGAGCAGCAATGGGCA-AAGCTGC--GCCATGTCA-TCG--ACATTGCCAAC--GATGTGTGGA--GAT-AATCT
34  ----------------------------A--AAATAATAA-ATT--ATTATAATAGTAAAAGTTGACATCATTT-ATTTT
35  AATGAAGGAAGGCAATTTTCG-GCCATTT--TTAGCGGGT-AGA--TGACTGCTTTATCATAACACATAACCGA-ATTAT
36  CTTAAGTAGGTGATATAATTT-CCTTTTA--AGGCATTAT-TTT--TGAATTAAATCATATTATTTAAATTGGA-AATAT
37  --------------------------------------------------------------------------------
38  --------------------------------------------------------------------------------
39  ----------------------------------------------------------------------TCTA-TTCCC
40  ---------------------------------------------------------------------TCAAA-ATCTT

  
0  ATTAAT__CC_TATAA__AA____AA______A_GTCGGGTTGA_C___T_TA__T_G_T___T_A___GA_AT_T___G
1  TATTGC--AT-ATAGC--CT----CA------G-TTTATGGTAT-T---C-TA--T-C-T---T-A---GA-AT-T----
2  ATTTTT--TC-TTACA--AA----AC------A-GA---GTTGA-C---T-TA--T-A-T---------GA-AT-T---G
3  ATTGA---CA-TAAAAGTAA----AA------A-GGTAGTATGA-T---A-AA--G-A-G---T-A----A-AT-A---A
4  ATTTAT--GA-TATTA--TA----TA------T-AA----TTGA-C---A-GC--T-A-AA--T-A---GT-AA-T---A
5  CAAGAA--TG-CGCAA--TT----AA------A-TCATAGTAGA-C---A-AA--T-C-G---G-A---TT-AA-T---G
6  CTTTTT--AT-TTTCA--AA----AA------A-GTC---TTGA-C---ACTA--T-A-T---T-C---AA-TA-T---C
7  CAAATC--CC-TTATT--GA----CA------A-TTAGTAAAAA-C---C-GT--A-A-T---A-G---TA-TG-A---T
8  ATTGAT--TA-TTTTA--AT----GT------T-ATCAGTTAGA-A---T-AT--T-A-T---A-AAGTTA-AT-T---T
9  TTTAAA--TT-TACTG--TT----GA------C-AATCAACAAG-T---A-AA--C-A-A---G-A---TA-TA-C---T
10  TTGACA--GT-CCTAT--AG----GC------G-CATGCTAAGA-T---A-GG--T-A-C---A-C---TG-AA-T---T
11  ------------TTAT--TG----AC------G-AAACATTAGT-A---C-GA--T-G-G---T-A---GG-AT-T---A
12  GTTTTT--AC----AA--AA----AT------A-TT-----TGA-C---A-TA--C-C-T---T-G---TA-AAGT---G
13  ATTAAA--ATATTTAA--AA----TA------A-TAAGTGTTGA-CG--T-TA--T-T-G---C-A---AA-TA-T---C
14  ATTAAA--GT-CAAAA--AA----AT------A-AATTGACAAA-G---T-AA--T-T-T---T-A---GA-AT-G---A
15  TTTACA--AA-ATTTT--TA----TT------T-TACGTGTTGC-C---TGTA--CAG-T---T-A---TA-AT-----G
16  CTTGA----C-TTTAA--AATTTCAA------A-GT---GATAA-T---A-TA--G-A-T---T-A---CA-AC------
17  TAAATT--TG-GAGAA--AG----GG------A-AAAACGCCAG-A---T-AT--C-T-T---T-T---GG-CA-C---T
18  --------------TT--AT----TG------A-CGAAATTTTA-C---T-AAGGT-G-T---T-A---GG-AT-T---A
19  GTTTTT--AG-CTGCA--AG----TG------G-TATGATGATT-T---C-AA--T-C-C---A-A---TT-TA-A---G
20  GGTAAT--AT-GAAAA--AA----CA------A-GAAACGTC-A-C---T-AT--A-G-T---C-A---CA-AA-T---G
21  TTTAAA--CT-TAAAA--AAGC--AT------T-GACAAATTAAGC---T-AA--T-A-TGCGT-A---TA-TT-T---T
22  TTTAAA--AC-T-TAA--AA----AA-----------GCATTGA-CAAAT-TA--T-C-T---T-A---AA-AT-G---C
23  --------------------------------------------------------------------------------
24  TTTTTT--TA-ATTAC--TT----GA------C-TTTTGAAATA-A---T-TA--A-A-T---A-T---AT-AA-T---A
25  ---AAT--TT-TTATT--GA----CA------A-GATTTAAAAT-A---A-GA--T-A-T---A-T---AA-TC-A---A
26  GCCTAT--TT-CTTCT--GA----AT------C-ATATTGACAT-T---G-CA--A-A-C---C-C---TT-TT-A---C
27  AAAGAG--AT-TGACA--TC----AA------T-CTGAGTCTTC-T---T-TA--T-G-A---T-A---AA-CG-T---A
28  TTTAAT--CA-TAAAG--TA----AA------A-TAAACGAT-------T-CA--T-A-T---A-T---GA-AT-A---G
29  CGTTGA--CA-ATTAA--AA----AG------A-ATTGTACTAT-A---G-TA--T-AAT---T-A---CT-AT-TTA-G
30  ATTATT--G----TAA--AA----TT------A-CT-GTATTGA-C---A-TT--T-T-T---T-A------AT-T---T
31  TTTTTA--CC-GTGAT--AT----TA------T-TCTGACAATG-A---A-CA--T-G-C---G-A---AT-AG-T---G
32  ----------------------------------AAAGCATTGA-C---A-AT--T-G-A---T-C---CA-AA-A---G
33  ATCATT--GA-CAGAA--AT----AG------A-AAATGTGTGA-A---T-AA--T---------A---GATAC-T---A
34  ATTGA---CA-TTTAA--TC----AT------TCGCCGTGCTAT-T---C-TA--C-A-T---T-AA--GA-AT-TTCCG
35  TATTGC--AT-CTGAC--AC----CA------G-TTTATGGTAT-T---C-TA--T-C-T---T-A---GA-AT-T----
36  ATGAATTGCG-TATAA--AA----AAGACTAAA-TTCATATTGA-CAT-T-TA--A-A-TA--T-A---TA-CT-A---A
37  --------------------------------T-TTATGATTGA-C---G-TA--C---T---A-A---GG-AT-T---A
38  ---------------------------------------------------CG--A-T-G---G-G---AT-AA-T---T
39  CTCCAT--TT-TTTTC--GT----TC------A-TATGGATTGC-T---T-TA--T-T-C---CCA---TC-AT-T---C
40  TTCATT--GA-CAGGC--GG----AT------A-TTTCCTGCTT-A---T-AA--T-G-G---C-A---AT-CA-A---G

  
0  ___T_G_C_TA__A___AA___T__T____T____AC___TA__CA___A_____A_____T__C_TA_A______A___
1  ----------A--A---AA---T--T----T----A-------------------------T--C-T-------------
2  ATAT-A-T-TA--G---AA---T--A----T----AT---AA--AA---A-----A-----T----TA-A------T---
3  ---T-T-T-TA--AC--AA---T--T----T----AA---TA--C----------------T--T-TA-A------A---
4  ---T-G-C-TA--ATATAA---A--T----T----AG---TA--AA---ATAATTA-----A--A-TA-A------A---
5  ---T-G-G-TT--AT--AA---T--G----T----AT---TA--TA---------------T--G-AA-A------A---
6  ---T-T-A-TA--A---AA---T--T----TCT--AT---TAATTA---A-----A-----T--A-TG-A------C---
7  ---A-A-T-TA--A---AA---T--T----T----AA---TA--CG------------------C-TA-A------T---
8  ---T-T-T-AA--A---AA---T--T----T----AA---TA--TA---G-----T-----T--------------A---
9  ---T-T-T-AA--C---AA---T--T----T----AA---TAAGCA---A-----A-----T--C-T-------------
10  ---A-A-T-AA--A---AA---A--T----A----ACCATTA--AC---A-----A-----T--A-TG-A------T---
11  ---A-----TA--C---AA---A--T----T----AA----A--TA---T-----G-----C--T-TT-A------A---
12  ---T-G-A-TA--T---AG---T--A----G----AC---AG--CAGAAA-----A-----T--T-TA-A------T---
13  ---T-T-G-TA--A---CG---T--T----A----AA---CA--CA---A-----T-----T--C--A-A------T---
14  ---T-A-C-TATTA---AA---A--A----A----AC---AA--AA---T-----T-----T--A-AT-A------A---
15  ---T-G-A-TA--A---AA---T--A----A----AC---TT--TG---A-----A-----T--T-TA-A------T---
16  -----G-CATA--A---AA---T--T----T----AA---TA---A---A-----A-----TGGC-TC-A------A---
17  ---T-C-C-TG--A---CA---C--G----A----AA---AT--TT---C-----A-----T--A-TC-C------G---
18  ---A-----TA--C---AA---A--T----T----AA---AT--GA---T-----G-----C--G-TA-A------A---
19  ---T-G-A-TT--A---AA---A--A----A----AC---TA--AA---T-----A-----A--A-TT-G------C---
20  ---A-A-G-TG--A--------T--T----T----AA---TA---A---T-----A-----T--G-TAGA------A---
21  ---T-AAC-TA--A---CAGGTT--T----T----TC---TA---A---A-----A-----T--A-TT-T------T---
22  ---G-T-A-TA--T---TT---T--T----A----AC---TA--AC---A-----GGTTTTT--C-TA-A------A---
23  --------------------------------------------------------------------------------
24  ---T-G-C-TTT-A---AA---T--T----G----AA---TA--AAT--A-----A-----T--T-TA-A------A---
25  ---A-T-A-CA--A---TA---T--A----A----AA---AG--TG---A-----A-----T--A-AA-A------A---
26  ---G-A-T-AA--G---AT---A--T----T----TC---AT--TG---A-----G-----C--G-GA-T------A---
27  ---T-T-C-TT--C---AT---T--C----TGAAAAT---TA--CA---T-----A--------C-TC-A------A---
28  ---TAG-G-AA--A---AA---T--T----G----AA---TA--TA---T-----T-----T--A-TG-A------T---
29  ---T-G-A-TA--A---AA---T--T----T----CA---TA--TT---A-----T-----T--T---------------
30  ---A-A-C-TA--A---TA---TAAT----A----AA---AA--CA---A-----A-----T--T-TA-ATGTAAAA---
31  ---T-A-A-GA--A---AA---T--C----T----CT---TA--CG---A-----A-----T--AGTA-A------G---
32  ---T-A-A-TA--A---TA---T--TAAGAT----AA---TT--GA---A-----A-----T--C-TG-A------A---
33  ---T-C-A-GA--A---AA---T--T----T----AA---TA--AA---A-----A-----G--G-TT-T------T---
34  ---G-A-C-GA--A---AA---A--G---------AC---TA--TA---T-----A-----T--T-TC-T----------
35  ----------A--A---AA---T--T----T----A-------------------------T--C-T-------------
36  ---C-T-A-TA--A---TA---T--T----A----AA---TA--AAGA-A-----A-----T--T-AA-T------A---
37  ---T-C-T-TG--T---AA---C--G----T----AA----A--CG---T-----A-----A--A-TA-A------GCAT
38  ---C-A-A-AA--T---AA---T--T----T----A----TA---A---A-----A-----T--C-TA-T------A---
39  ---T-G-A-TA--T---GA---T--T----A----CT---TA--AA---C-----T-----T--CATA-T------T---
40  ---A-T-C-AA--G---TG---A--A----C----AG---TG--AT---A-----A-----T--A-AA-A------A---

  
0  AA___________C______T__T___ATCAAGAGC_GGCTGAGGGACT_G_GACC_TAT_GAAG_CC_CGGCAAC__C_
1  -------------C------T--T---ATCCAGAGC-GGTAGAGGGACT-G-ACCC-TTT-GAAG-CC-CAGCAAC--C-
2  ACTT---------C------T--T---ATCGAGAGA-AGCTAAGGGACC-T-GGCC-TGTTGACG-CTTCAGCAAC--C-
3  AT-----------CTC----T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-GAT-GAAA-CC-CGGCAAC--C-
4  AAGCT--------C------T--T---ATCGAGAGA-GGTGGAGGGAAA-G-GGCCCTAT-GAAA-CC-CGGCAAC--C-
5  TA-----------C------T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-GCT-GAAA-CCTCAGCAAC--A-
6  AATT---------C------T--T---ATCCAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-AAG-GAAG-CCTCGGCAAC--A-
7  AT-----------C------TCTT---ATTGAGAGT-GGCTGAGGGACT-G-GCCC-TGT-GACG-CC-CGGCAAC--CG
8  GA-----------C------T--T---ATCAAGAGA-GATGGAGGGATT-G-GCCC-GAT-GAAGTCT-CAGCAAC--C-
9  -------------C------T--T---ATCAAGAGT-GGTGGAGGGAATAG-GCCC-TGC-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
10  AT-----------C------TCTT---ATCTAGAGC-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TTT-GAAA-CCGCGGCAAC--C-
11  CT-----------C------T--T---ATCGAGAGA-GGTGGAGGGATG-T-GCCC-TAA-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
12  AA-----------CACGCTCT--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGAAA-GAGCCC-GAT-GAAA-CC-CGGCAAC--C-
13  AA-----------C------T--T---ATCAAGAGA-AGTGGAGGGACT-G-GCCC-AAA-GAAG-CTTCGGCAAC--A-
14  AT-----------C------T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TGT-GAAA-CC-CAGCAAC--C-
15  AAGGATT------C------T--T---ATCAAGAGA-GGCGGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GAAA-CC-CGGCAAC--C-
16  TC-----------CTC----T--T---ATCAAGAGT-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-GAT-GAAA-CC-CGGCAAC--C-
17  TT-----------C------T--T---ATCAAGAGA-AGCAGAGGGACT-G-GCCC-GAC-GAAG-CTTCAGCAAC--C-
18  CT-----------C------T--T---ATCGAGAGT-GGTGGAGGGATG-T-GCCC-TAC-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
19  T------------C------T--T---ATAATGAGT-GGTAGAGGGACT-G-GCCC-GTT-GAAA-CC-CGGCAAC--C-
20  AT-----------C------T--T---ATCCAGAGT-GGTGGAGGGAAA-T-GCCC-TAT-GAAG-CC-CAGCAAC--C-
21  CT-----------C------T--T---ATCGAGAGC-GGCAGAGGGACT-G-GCCC-GAT-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
22  ATATTTTCT----C------T--T---ATCGAGAGC-GGCAGAGGGACT-G-GCCC-GAT-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
23  --------------------------------------------------------------------------------
24  ATAT---------C------T--T---ATCAAGAGC-GGTTGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GAAA-CC-CAGCAAC--C-
25  AAG----------C------T--T---ATTAAGAGC-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
26  CT-----------C------T--T---ATCCCGAGCTGGCGGAGGGACA-G-GCCC-TAT-GAAG-CC-CAGCAAC--C-
27  TA-----------T------T--TTCTATCCAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GAAA-CCTCGGCAAC--A-
28  AAGGT--------C------T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GAAA-CC-CAACAAC--C-
29  -------------C------T--T---ATCAAGAA--GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GAAG-CC-TGACAAC--C-
30  AT-----------C------T--T---ATCAAGAGT-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TTT-GAAA-CC-CGGCAAC--C-
31  AAAACT-------C------T--T---ATCATGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-GAT-GAAG-CC-CAGCAAC--C-
32  TATGAAGTTGTACC------T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GATA-CC-CGGCAAC--CG
33  C------------C------T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TGC-GATA-CC-CGGCAACCGC-
34  -------------C------T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGAAG-T-GCCC-TAT-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
35  -------------C------T--T---ATCCAGAGC-GGTAGAGGGACT-G-ACCC-TTT-GAAG-CC-CAGCAAC--C-
36  AATTAGTGCA---C------T--T---ATCAAGAGA-GGTGGAGGGACC-G-GCCC-TGT-GAAG-CC-CAGCAAC--C-
37  CA-----------C------T--T---ATCTAGAGA-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TAT-GAAG-CCTCGGCAAC--A-
38  TTTT---------C------T--T---ATCAAGAGCAGGCAGAGGGACG-A-GCCC-GAT-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
39  TT-----------C------T--T---ATCCAGAGT-GGTGGAGGGACT-G-GCCC-TGT-GAAG-CC-CGGCAAC--C-
40  GA-----------C------T--T---ATCGAGAGA-GGCAGAGGGACT-G-ACCC-GAT-GATG-CC-CGGCAAC--C-

  
0  _T____________G_C__A_________T_A____________G___T__T___________T________G_______
1  -T------------A-C--A---------C-A------------T---A--TAAG--------T--------G-------
2  -T------------C-T--A---------T-C------------TCCAT--T-----------A--------G-------
3  -A------------G-C--C---------TTA------------G---G-----------------------G-------
4  -A------------A-T--A---------T-T------------T---T--T-----------A--------GAAGTAT-
5  -G------------A-A--C---------G-C------------A---T--C-----------T--------G-------
6  -G------------A-C--T---------T-A----------------T--T-----------T--------GAT-----
7  -T------------T-C--A---------T-C------------G---TAAT-----------T--------C-------
8  -A------------G-C--C---------T-A------------G---A--TAA---------G--------G-------
9  -T------------G-T--AGCAA-----T-T------------G---C--TAT---------T--------G-------
10  -T------------T-C--A---------T-A------------A---T--TAAA--------T--------G-------
11  -G------------T-C--T---------A-A------------A---A--T-----------A--------G-------
12  -T------------GTC--C---------T-T------------T---T--A-----------A--------GGA-----
13  -T----------------------------------------------T--G-----------T--------A-------
14  -G------------G-T--AA--------T-T------------C---T--T-----------T--------G-------
15  -A------------A-A--AA--------T-A------------A---TAAT-----------T--------T-------
16  -G------------G-C--ACG-------T-A------------A---G--T-----------G--------C-------
17  -G------------G-T--G---------T-A------------A---T--GGCGATCAGCCAT--------G-------
18  -G------------T-C--T---------T-A------------T---A--T-----------A--------G-------
19  -T------------T-TCAA---------T-AC-----------G---T--T-----------G--------A-------
20  -T------------A-A--A---------C-AATAATTCATTATG---T--G-----------T--------T-------
21  -TAACTTTATTTAAG-C--A---------T-A------------A---A--G-----------T--------G-------
22  -T------------AAC--T---------T-T------------A---T--T-----------TAAGC----G-------
23  ----------------A--A---------A-A------------A---T--C-----------C--------C-------
24  -T------------A-T--A---------C-A------------C---A--A-----------A--------G-------
25  -T------------G-T--A---------T-ATGT---------G---T--T-----------T--------GCATATTA
26  -G------------G-T--T---------T-C----------------T--C-----------T--------G-------
27  -T------------------------------------------------------------------------------
28  -A------------G-C--A---------T-T------------T---T--T-----------TAATTAGATG-------
29  -G------------G-C--A---------A-A-------------------------------T--------G-------
30  -A------------G-T--A---------T-A------------T---T--T-----------T--------T-------
31  -G------------C-C--AAGCAGCAAAT-C------------G---C--T-----------T--------G-------
32  CT------------G-T--T---------TCA------------A---A--C-----------A--------G-------
33  -T------------G-T--T---------T-A------------A---C--A--------------------G-------
34  -A------------T-C--A---------ACA------------C---TG-T-----------T--------G-------
35  -T------------A-C--A---------C-A------------T---A--TAAG--------T--------G-------
36  -T------------G-T--A---------T-AT-----------G---T--TAATTA------T--------A-------
37  -T------------C------------------------------------------------T--------C-------
38  -G------------A-C--T---------T-A------------T---A--A-----------A--------G-------
39  -T--------------C--T---------T-T------------T---T--T-----------T--------A-------
40  -C------------G-T--T---------T--------------G---T--T-----------A--------G-------

  
0  T__________A_________A_______G____GTGCTACT_TC___C___AGC__AAAAT___GA___ATT___CC__
1  A----------A---------A-------G----GTGCTAATCTG---T---TGC--AGGAG---TA---ATA---TC--
2  A----------A---------A-------G----GTGCTACC-TC---C---AGC--AAGAT---GT---ATG---TC--
3  C----------A---------T-------G----GTGCCAAT-TC---C---TGC--AGC-----GG---TTT---CG--
4  T----------A---------A-------G----GTGCCAAT-TC---C---TGC--AGAAA---G--------------
5  T----------C---------T-------G-----TGCTAAA-TC---C---TGC--AAGC-----A---ATA---GC--
6  T----------A---------A-------GTACTGTGCCAAT-TC---C---AGT--AGCGT---AA---TTG---CT--
7  C----------AGTGATGAATA-------G----GTGCTAAA-TC---C---TGC--AAAATAC-GG---ACA---GT--
8  T----------A---------T-------G----GTGCTAAT-TC---C---A-----ATAG---GC---TTA---CA--
9  A----------A---------A-------G----GTGCTAAA-TC---C---TAC--AGACT---TC---ATC---G---
10  A----------A---------A-------G----GTGCCAAT-TC---C---TGCAGAAAAT---GA---AAG---ATGA
11  A----------A---------AT------G----GTGCCAAT-TC---A-----C--ATAAA---GT---ATA---AC--
12  T----------A---------A-------G----GTGCCAAT-TC---T---CTC--AGAAG---AT---TTT---TT--
13  T----------C---------A-------T----GTGCCAAT-TC---C---AGT--AACCG---AG---A---------
14  C----------G---------G-------T----TAAAACAA-TG---C---TGA--TTTTA---AA---ATA---AA--
15  T----------A---------A-------G----GTGCCAAT-TC---C---AGC--AGG-T---GA---AAC---C---
16  T----------T-----------------G----GTGCCAAT-TC---C---TGC--AGGTT---GG---GGTTACCC--
17  ACC--------A---------A-------G----GTGCTAAA-TC---C---AGC--AAGCTC--GA---A------C--
18  A----------A---------AT------G----GTGCCAAT-TC---A-----C--ATAAA---GT---TTT---AA--
19  A----------A---------A-------G----GTGCTAAA-TC---C---TGC--GAAGT---GT---GAT---GC--
20  T----------A---------A-------G----GTGCTAAG-TCATGC---AGA--ACAAC---TA---ATT---G---
21  -----------A---------A-------G----GTGCTAAT-TC---C---AGC--AAAATGGTGT---ATT---CC--
22  TAAAGTG----A---------A-------G----GTGCTAAT-TC---C---AGC--AAAAT---GGTGTATT---CC--
23  T----------T---------T-------G----GATGACAA-AA---A---AAA--GAAAC---AG---CAC---CT--
24  T----------A---------T-------A----AAG-------------------------------------------
25  T----------A---------A-------G----GTGCTAAA-TC---C---TGC--GGTGT---AA---ACC---GA--
26  T----------T---------A-------T----TTATTATG-TT---C---AAC--TGAGT---GA---GAC---AA--
27  T----------A---------T-------T----GTGCCAAT-TC---C---AGC--AAGCG--------------CT--
28  T----------A---------T-------G----GTGTTAAT-TC---C---TGC--AAAGT---TA---ATT-------
29  T----------A---------C-------G----GTGTTAAT-TC---C---TGC--AAAAC---TT---ATT---TG--
30  T----------A---------ATATATGTG----GTGCTAAA-TC---C---TGC--AGCAA---AC---GCT---GA--
31  G----------A---------AAA-----G----GTGCTAAT-TC---C---TGC--AAAGC---GA----TG---C---
32  A----------A---------T-------G----GTGCTAAA-TC---C---TTA--AGAAC--------ATT---GC--
33  A----------A---------T-------G----GTGCTAAA-TC---CTTTAGA--GCAAT---GA---TTG---C---
34  A----------A---------AT------G----GTGCCAAT-TC---A---CAC--GAAGC---G-----TT---CA--
35  A----------A---------A-------G----GTGCTAATCTG---T---TGC--AGGA----GT---ATT---AT--
36  C----------A---------A-------G----GTGCTAAT-TC---C---TGC--AGCGC---TA---GCT---GA--
37  G----------A---------A-------T----GTGCCAAT-TC---C---AGT--AACCG---TA---ATG---G---
38  C----------A---------C-------G----GTGCTAAT-TC---T---TGC--AGCTA---GC---GGC---TG--
39  A----------AGA-------A-------G----GTGCCAAT-TC---C---AGC--AGAAC--------ATG---AT--
40  CCAAGCAAACGA---------A-------G----GTGCTAAT-TT---C---AGC--AGAAT---GA---TTT---C---

  
0  ____ATTTTGA_AAGATAA__G___G__G___CT__GC___A____TGC_T_GTT___C__CTG__TC__T__T__TCTT
1  -----TCCTGA-ACGATGA--G---A--G---CA--AA---G----GTA-T-AAT---T--ATA--GC--C--T--TTCT
2  -------TTGA-AAGATAA--G---A--G---TC--CA---G----ATT-A-AAA---A--AAA--TC--C--G--CGAC
3  ----CT---GA-AAGATGA--G---A--G---AT--TC---T----TGT-A-GTC---T--CT---TC--T--T--T--T
4  -----TTCTGC-AAGATAAGAG---G--G---CT--GGCAAA----TAA-A-AAG---C--AAG--TC--TC-T--TCTT
5  -------TTGA-AAGATAA--G---T--T---GA--GG---T----TAT-C-GTA---A--TAT--CC--A--A--GTTC
6  ----AGAAGAT-GAGAAGA--G---T--A---TA--TA---G----TAC-G-GTT---T--CCT--GT--A--C--CCTC
7  ----ATTTTGA-GAAATAA--G---A--G---AG--GT---G----ATG-A-ATG---A--CTT--AC--G--T--AGTG
8  ----AGCCTTA-AAGATAA--G---A--A---GA--GCT--A----TGT-A-TTTTAAC--CCT--TC--T--T---CTT
9  ------TCTGG-AAGATAA--G---A--G---GA--GG---T----TCG-G-TTT---T--AAA--CA--G--A--CAAA
10  GAGAACGTCAG-ACGATAT--A---C--G---AT--AA---A----TAC---GTA---C----G--TC--T--T--TCTG
11  ------TTTAG-AAGATGA--G---A--G---AA--AG---A----ACA-T-TTC---A--ACA--AA--T--G--CTTT
12  ----CTTCTGA-AAGATGA--G---G--G---T--------A----TGC-C---------------TC--T--T--CTTT
13  ----AGGTTAG-AAGATAA--G---G--T---TA--AA---C----ACG-A-CGT---T--AAC--TG--A--G--ACTG
14  ----AAAATCA-GTAGTAA--T---T--T---CC--TA---T----GCA-A-AGA---T--TTA--TA--G--C--GGTG
15  --------TGA-CAGATAA--G---A--C---GT--AG---A----GGAAT-ATA---A--ACT--TC--T--T--GCTT
16  ----AGCCTGA-GAGATGA--G---A--G---GA--GA---G----GCC-G-AGT---A--ATT--GT--G--A--TTAC
17  ----AGCTTGG-AAGATAA--G---A--A---GA--GA---C----AAA-A-TCA---C--TGA--CA--A--A--GTCT
18  ----CTTTTGA-A-GATGA--G---A--G---AA--AC---AATACTAC-T-ATT---G--CTT--TC--T--CAATTTT
19  ------TTCGA-GAGATAA--G---A--G---AG--AC---T----TAA-A-AAG---T--TTC--AG--T--G--TATT
20  -----TTCTGA-AAGATGA--G---A--A---GG--AA---G----TTA-G-TCC---A--TTT--GA--A--A--AAAT
21  ----GTTTTGG-TAGATAA--GAGGA--G---CT--GG---A----TA--T-GTT---CGACTT--TC--CACT--TCTC
22  ----GTTTTGG-TAGATAA--G---A--GGAGCT--GG---A----TA--T-GTT---CGACTT--TCCAC--T--TCTC
23  ----CTGTATA-GAGAGTA--T---G--G---GC--AG---G----ATG-A-TAG---C--GGC--GA--T--A--AGAA
24  --------------------------------------------------------------------------------
25  ----GAGATGA-GGATTTG--A---A--G---GT--AA---A----AAA-C-CTG---A--GGA--TG--A--C--CTCA
26  ----CCAAGGT-GCTAACC--T---G--T---TG--CA---A----GGT-T-GTA---T--GAT--TC--C--T--TGAG
27  ----AGCTTGA-AAGATAG--G---A--A---AG--CA---A----GGT-T-TAT---A--CCG--GC--G--T--CTGC
28  -------TTGA-GAGATAA--G---A--G---GA--TT---A----TAA-A-ATT---T--TAG--AA--A--G--CTAA
29  -----TTTTGA-AAGATAA--G---A--A---AA--CA---G----CTT-A-TTA---A--TTA--AT--G--A--GTAT
30  ----TAGATGA-GA-ATAA--T---C--G---C---GA---A----TGT-A-AAG---C--CCG--AG--G--T--TATT
31  ------TTTGA-GAGATGA--G---A--G---AA--GGG--A----AGA-C-GTAAAAC--ATT--CC--T--T--TCTG
32  ----GTTCTTG-CAGATGA--G---GCGG---AG--AT---T----TGA-TCGTT---C--AAGC-TC--T--T--CCTT
33  -----TCTTGA-A-GATAA--G---G--T---TG--AG---A----TTG-T-CAC---G--CAAGCTC--T--T--CCTT
34  ----GCTTTGA-AAGATGA--G---A--G---AAAGGC---A----TTT-T-ATA---T--AAG--CC--T--T--TCTG
35  ----CTTCTGA-ACGATGA--G---A--G---CA--AA---G----GTA-T-AAT---T--ATA--GC--C--T--TTCT
36  ----GAGATGAGAATATAA--A---T--C---GA--GC---T----TTT-A-GAG---C--CAG--AG--T--T--TATT
37  ------TTTGA-A-GATAA--G---C--A---GG--TA---A----AGC-A-C---------------------------
38  ----AGAGATA-AGATTCG--G---A--C---GA--GA---A----ACG-A-AAC---C--TCT--TT--A--G--ACGC
39  ----GTTCTGA-AAGATAA--G---A--A---GC--GA---A----CGG-A-TCG---C--ACG--TC--T--T---CTT
40  ----ATTCTGG-AAGATAA--G---C--G---AA--G----------GC-G-AAA---A--C-----C--T--T--TCCT

  
0  _TC_CGCCGG_AT_T___G__A_AAG__TTTTT____T_AT_TTTAAG_AGGTA___AAAAGGCTATCTGTATATCAGCA
1  -CT-ATTCGT-GC-G---C--G-TTT--CGTGC----A-AA-ATAGAG-AGAGG---CTTTTTATATGAGACGTATTTGG
2  -GC-TCTTAT-TT-A---T--T-AAG--GGCAT----C-GC-GGATTT-TCTTA---TATTAATTTTATTTTTAAAGGAG
3  -AG-CGAAGG-G------------AC--TTTTT----T-AT-TTTTA------A---AAAAGGAGGGGCATTAA------
4  -AT-CGGAAG-A------G--G-CTT--TATTT----T-TA-TATAAG-AGCTA---CACAATAGGAGGTAAAAGG----
5  -TC-TCTTCT-TA-T---C--T-TTA--TCATG----T-TT-TTTAAT-AGAAG---GGATGGATTTATAT---------
6  -TT-CTTACT-TG-T---A--G-AAG--GGGGT----T-TT-TACTTT-TCCCT---ATTCTCTGTACAGAACTGTCATA
7  -TA-ATGTTA-TG-C---C--T-CTC--GATTT----C-AC-ATCGGG-AGGCA---TTTTTTAGTTTCCCGGAAAAATT
8  -AC-TTTTAG-AA-G---A--G-GGG--TTTTT----TGAT-TTTTAG-AATAG---GAGGAGATTATT-----------
9  -GT-CCTCTT-CT-T---A--T-GAA--GGGGG----C-TT-TTTTTA-ATCCT---TCTCTTATTACTTTAAAAATAAT
10  -TT-CTCTT--AC-A---G--A-AAGGCGTTTT----T-AT-TTTGAC-GAATT---ATGGGGAAACTATACGAAATGGT
11  -CT-CAAATT-TT-C---T--A-AAA--ATTGA----G-AA-AGCATT-TTTAA---TTTGATTACTAAGCAACATAAGG
12  -TA-GAAGGG-GT-T---T--T-A-----TTTT----G-CT-CTTAAGGAGGGA---AGAAG------------------
13  -GG-GCATGA-TT-A---C--G-TGT--CCTGG----T-TT-TTTATT-TTTGA---GTTATTGATTAAATAGATAGGAA
14  -CT-AAATCC-TG-C---G--G-TAG--AAACT----G-AG-AGATAA-GAAAG---AGAGTCTGTAAGAATAATAACTT
15  -TT-ATCTGC-AA-----G--A-AGT--TTTTT----T-AT-AATTAA-AG-----------------------------
16  -TA-GGCCCT-CT-T---C--T-CAT--TGAAG----A-GG-GCCTAA-GAATT---TTTCTGGAGGTGCAAA-------
17  -TC-TTCTTA-AG-A---G--G-ACT--TTTTT----T-AT-TTCTCT-TTTTT---CCTTGCTGATGTGAATAAAGGAG
18  -TC-TATCGATAT-T---GAGA-AAGCATTTTT----T-AT-TTTATT-AAGCA---ACACAGGGAGGAATCAAC-----
19  -TG-TGTATC-GA-A---A--C-TTC--CAAAC----C-TC-TCTAGT-TCTCT---AGGGAGGTTTTTTATTGGCAAAA
20  -GC-TGCCTT-TC-T---G--C-TCA--TCAGC----A-GA-AAGGCT-TTTTT---TGTATATCAGAATGTAGAAAAGG
21  -TA-TTCTAA-AA-TAGAG--A-AGT--TTTTT----T-AT-TGCTTT-CATGA---ATAAATCTGGATAATCACACAAC
22  -TA-TTCTAA-AT-A---G--AGAAG--TTTTT----T-TA-TTGCTT-TCATG---AATAAATCTGGATAAATAATCAA
23  -TT-TTCTTT-CA-C---T--A-AGC--TTTTT----T-AT-TTTAAG-AGGTTTCCAACAGGGTTGCTGTAGATCAAAA
24  --------------------------------------------------------------------------------
25  -GG-TTTTAT-TT-T---T--T-TAT--TTAAC----T-AG-GGGGAA-TGACA---A----------------------
26  -CG-ATAAGA-GT-G---A--A-AGG--CACAA----A-GA-CCAAAC-CCTTT---CCTCGATGGAAAAGGTTTTTTTA
27  -CT-GTAACA-GA-G---C--G-CGC--CTATA----T-AT-GAATCT-CTTTC---CATCTTCGGAAAGAGATTTTTTT
28  -AA-TCCTCT-TC-A---A--C-TAA--GAAGA----G-GA-TTTAAT-TTTAT---ATATTTTTAGGTTTAGATATTGA
29  -GT-TAATAA-TC-C---G--T-TTT--TCTTA----T-TG-GAAAAT-GGATT---TTTTTTATATATTAAAATTTAAA
30  -TC-CAAGGG-CT-T---T--T-TAT--TTTATCCTAT-TT-TTTAAG-GGGGC---TAACTT-----------------
31  ----CTCATG-GC-G---G--A-AAG--GTTTT----T-TT-GTTCTA-TTATG---CAGTTTGATTCACGGAATTGTAC
32  -ACACAAAGG-A---------A-GAG--CTTTT----T-AC-ATGCTT-AATAT---TTCAGAAAAGAGGCGAATAAC--
33  ATC-CAAAGG-A---------A-GAGC-TTTTT----T-ATATTTGAA-TGGAA---AGAAGGAATGGACAAC-------
34  CTC-AAGTGT-GC-A---G--A-AAG--GCTTT----T-CT-TTT--G-CAGAA---AAAACCGGAAGATTTCTTAGAAT
35  -CT-ATTCGT-GC-G---C--G-TTT--TGTGC----A-AA-ATAGAG-AGAGG---CTTTTTATATGAGACGTATTTGG
36  ----CTCTGG-CTCT---T--A-TTA--TTTTT----T-AA-TCTAAT-GGGAA---AAGGTGAATGAC-----------
37  --------------------------------------------------------------------------------
38  -GA-TTGCAG-TT-T---G--A-AGA--GGTTT----T-TT-GAT-----------------------------------
39  -AT-CGAAGA-GG-T---G--T-TT---TTTCT----T-GT-TTTAAC-ACCTT---ATCTGTCGGAAAGATTACTTGTT
40  -TA-T--CGG-A---------A-AGG--TTTTT----T-TG-TTAGAG-AGCCA---AGTTTTTATAAAAATGAGGAGAG

  
0  GCCGCGAATCACATTACATGGGAAAAGACAACCGGCAGAAAGCTACTGTTTGTTTGTCTCCGAAAGGAGGAAAGAAGAA_
1  AGAGAACTAAAGGAGGAAAATAAAA-------------------------------------------------------
2  ATTGGTAAA-----------------------------------------------------------------------
3  --------------------------------------------------------------------------------
4  --------------------------------------------------------------------------------
5  --------------------------------------------------------------------------------
6  TGCTAGTTTCATAGAGCAAGACCCTACTCTATAAGACTAGCCCAAATCTAAAGGAGAAAGAAGGAAATTAAC--------
7  CACAACATGAGAAAAGAGGAAGGATTT-----------------------------------------------------
8  --------------------------------------------------------------------------------
9  AAATTCAAGGAGGAAACACG------------------------------------------------------------
10  TGCTGGAGAGTAAGAGGAGGAATAAAGA----------------------------------------------------
11  AGGCTATTAAC---------------------------------------------------------------------
12  --------------------------------------------------------------------------------
13  TTTTTTAGTATAAAATCTATCAATCCATTATACGGGAAAGTAGGTTAGATT-----------------------------
14  CTATCCTAGGATAGGAGTTTTTTTATTTTGTAGGATAAAGGATAGATTTATTAAATGGATTAGGAGGAGAGAAA------
15  --------------------------------------------------------------------------------
16  --------------------------------------------------------------------------------
17  GCAGACA-------------------------------------------------------------------------
18  --------------------------------------------------------------------------------
19  AATCGAGAGGATAAGGTGATAGGT--------------------------------------------------------
20  TGATAGAG------------------------------------------------------------------------
21  ATACTAGGGAGGAAAAAAG-------------------------------------------------------------
22  CATACTAGGGAGGAAAAAAAG-----------------------------------------------------------
23  AAACAAAAATCAGGAAGATAAGGTTTCCCTTGTCAAAGAGAGATCCAAAGGAGATT------------------------
24  --------------------------------------------------------------------------------
25  --------------------------------------------------------------------------------
26  TTTCATAAATATGCCAATTAACATTCTCTAATATAACTGTACATTGTATAAGAGGGAGCGAGTTCCGTATCATATATACA
27  T-------------------------------------------------------------------------------
28  AGTTAAAATATAATAAAAAGGGGATTTTAAAA------------------------------------------------
29  CTAGGACGGTGAAAAAA---------------------------------------------------------------
30  --------------------------------------------------------------------------------
31  TTTCTTACGATAATGATTTGCGTGCTCCTTGAGACGAAATTTGCGAGAGTGAGAGTTTTTGCTCTCGTACTGACTTTCGT
32  --------------------------------------------------------------------------------
33  --------------------------------------------------------------------------------
34  AGTGTTAAGGCAGGTGATTGCT----------------------------------------------------------
35  AGAGAATTGAAGGAGGAAAATAAAA-------------------------------------------------------
36  --------------------------------------------------------------------------------
37  --------------------------------------------------------------------------------
38  --------------------------------------------------------------------------------
39  ATTGTACCGAAAACAGCAAGACAAAAAAAGAACAACTTGGAATGAGGAGGCGTTGTAC----------------------
40  GGCATACGAAAGGGGAAATAATCAG-------------------------------------------------------

  
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26  AGGTCTTTCGGGAGGCCTTGTGCAGGAGGAAGCAAATC---------------
27  -----------------------------------------------------
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31  TAAATTGGTAACGCGTAGACGAACTGATATATTTTTAGAAAAGAGGGCTTAAC
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